Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCOF1Q13428 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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