Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms