Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR5A1Q13285 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms