Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms