Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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