Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CBX3Q13185 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CBX3Q13185 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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