Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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GPS1Q13098 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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