Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms