Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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