Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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