Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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