Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TP53BP1Q12888 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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