Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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