Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFCP2Q12800 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms