Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARHGEF5Q12774 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF5Q12774 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms