Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA3Q08378 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms