Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms