Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRTAP1-1Q07627 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP1-1Q07627 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms