Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms