Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREMQ03060 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREMQ03060 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREMQ03060 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREMQ03060 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREMQ03060 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms