Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APBA1Q02410 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms