Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms