Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms