Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms