Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms