Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms