Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P62684 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms