Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS3AP61247 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms