Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BACE1P56817 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BACE1P56817 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BACE1P56817 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms