Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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