Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTCP1P56278 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms