Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA1P56159 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms