Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO3P55854 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms