Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFDNP55196 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFDNP55196 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFDNP55196 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms