Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms