Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
THOP1P52888 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
THOP1P52888 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms