Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms