Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORCP51449 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORCP51449 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms