Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms