Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX2P50458 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX2P50458 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX2P50458 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX2P50458 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX2P50458 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms