Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSG1P42857 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSG1P42857 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NSG1P42857 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NSG1P42857 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NSG1P42857 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NSG1P42857 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms