Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP3P42574 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP3P42574 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms