Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBRP36941 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBRP36941 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBRP36941 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms