Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms