Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER4P35408 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms