Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP6P35125 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP6P35125 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP6P35125 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP6P35125 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP6P35125 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP6P35125 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms