Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MARCKSP29966 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MARCKSP29966 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms