Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms