Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIFP27352 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIFP27352 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIFP27352 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIFP27352 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms