Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms